Созданная в 1922 году Карачаево-Черкесская автономная область к началу Великой Отечественной войны входила в состав Орджоникидзевского (Ставропольского) края как Карачаевская и Черкесская автономные области. Из этих двух регионов на фронт были призваны и ушли свыше 46 тысяч человек, домой не вернулись более 23,5 тысяч.
В первые же недели войны предприятия начали работать для фронта. Механический завод «Молот» выпускал детали для артиллерийского вооружения, мастерские Автотранса — шашки, корпуса для гранат и бутылки с горючей жидкостью, обувная и швейная фабрики — белье, телогрейки и сапоги.
11 августа 1942 года после упорных боев фашисты захватили Черкесск и вскоре оккупировали всю территорию края. Борьба продолжалась на перевалах Главного Кавказского хребта, где действовали до 17 партизанских отрядов численностью порядка 1 тысячи 200 бойцов.
В ходе Северо-Кавказской наступательной операции 37‑я армия Петра Козлова, обойдя в буран Большое водохранилище, 17 января выбила врага из Черкесска. В течение следующей недели была освобождена вся территория региона.
В период оккупации, сражаясь в партизанских отрядах, погибли смертью храбрых первые секретари Карачаевского и Черкесского обкомов Максим Романчук и Геннадий Воробьев. Были казнены фашистами подпольщицы Марфа Кулакова, Анна Голоколосова и Зурият Тлисова.
13 уроженцев края стали Героями Советского Союза.
При штурме Вены вместе со своими подчиненными уничтожил и пленил 150 гитлеровцев, освободил более 1 тысячи советских и французских военнопленных гвардии капитан черкес Умар Хабеков. 10 апреля 1945 года он погиб при форсировании Дунайского канала.
Карачаевец командир танковой бригады полковник Харун Богатырев отличился при освобождении Киева и в боях за Житомир. В конце своего боевого пути он штурмовал Берлин и освобождал Прагу.